文|孟凌霄
又是一年开学季,对于刚加入实验室的科研新人而言,这段时间正是掌握领域内核心文献、确定研究方向的重要过渡时期。
然而,从下载论文开始,不是遗漏所在领域的关键研究,就是同一篇文章重复下载。想找导师在组会上推荐的一篇文章,却翻来覆去想不出关键词。眼看电脑桌面上的未读论文与日俱增,真正读进去的却寥寥无几。写论文时手动调整参考文献格式的方式,还停留在上个世纪。
效率低下的文献管理方式,大大拉低了科研新人的工作效率。
对此,美国加州大学圣地亚哥分校的生物医学博士生Maya Gosztyla深有同感。她在Nature发文回忆道,过去自己习惯于把海量论文放在浏览器书签里,结果是电脑和大脑双双崩溃。经过文献阅读工具的大量试错和反复迭代,她终于找到了最适合自己的现代化文献管理系统,以下是她的自述:
Maya Gosztyla 图源:个人主页
第1步 寻找
以前,我总是漫无目的地寻找新的论文。但是,无关的推文总会分散我的注意力。我还注册了期刊邮件提醒,但这些邮件很快淹没了收件箱,我也开始忽略它们了。
一段时间后我发现,咨询聚合平台或许是个不错的选择,它能帮助你保持论文信息有条不紊。每天早上,我都会用五分钟的时间来浏览提要。对于大多数论文,我只是看一眼标题,然后滑过去。如果我看到任何有趣的东西,就会把它添加到“稍后阅读”文件夹中。
如果想更深入地了解特定的主题,也可以试试文献映射工具,如ResearchRabbit、Inciteful、Litmaps和Connected Papers。这些工具可以追踪论文之间的引用网络,让你掌握某一领域中最具突破性的论文。
第2步 管理
如果你还在手动调整参考文献的格式,那你绝对需要尝试一下自动生成系统,可以省下相当多时间。Zotero、Mendeley或Endnote这类工具不仅仅易于创建参考文献清单,它们还能在数据库中用文件夹、关键词和标签,来储存和组织你的论文。这些程序还有浏览器插件,只需轻轻一点就能保存论文,还提供文字处理器插件,以添加文本引用和构建参考著作。
当我找到一篇我想读的论文时,我会立即把它添加到我的参考文献管理器中。接着,我就能关闭浏览器标签,因为我知道它已被安全储存,以便之后再次找到。
第3步 阅读
这是最棘手的部分——你必须真正阅读论文。关键是要建立一个精简的流程,这里有一些建议:
纳入日程。例如,我会在周五上午留出几个小时,阅读我在一周内收集的所有论文。
制定流程。例如,我会首先快速浏览论文,如果是有意思的论文,我会仔细阅读,突出重点,并快速总结。
规划时间。如果你有一大堆论文要读,要么规划好一整块时间进行集中处理,要么全部删除后重新开始。控制好每次阅读论文的数量,可以大大减少拖延症的发生。
减少分心。在PDF阅读器中阅读论文,而不是在浏览器标签中阅读(提示:一些参考资料管理器,如Zotero,有内置的PDF阅读器,会自动将你的高亮部分提取为可搜索文本)。将电脑或平板电脑与Wi-Fi断开,将手机设为 "请勿打扰 "状态(如果可能的话,放在另一个房间)。
乐在其中。让阅读成为一种乐趣,让它成为你期待的事情。我喜欢在沙发上阅读,身边放上一杯可口的咖啡。
第4步 组织
一旦养成了良好的阅读习惯,就需要确保阅读笔记有条不紊,并且便于查阅。
我个人选择Notion,这是一款格式自由的应用程序,用于组织笔记、项目和任务等各类信息。我用它来管理与研究生学习有关的一切。Notion还可以通过一个名为Notero的插件,与我的参考文献管理器Zotero进行同步。每当我向Zotero添加一篇新的论文,该插件就会自动同步到Notion中。
如果你不熟悉Notion,也有更简单的选择——电子表格也能完成这项工作。无论你选择哪种工具,关键是要创建一个表格,详细记录你所阅读的所有论文。
这应该包括论文的状态(例如,你是否读过它),以及它可能与哪些项目有关。下面是我的表格(模板地址附文末)。
每篇论文都有一个包含我所有笔记的相关页面。如果你使用的是电子表格,你可以在线输入你的笔记,或者将每一行内容链接到单独文档中。一些参考文献管理程序,如Zotero,能帮助你将注释直接附加到参考文献中。
这些记录看上去费劲,但一个有组织的数据库,能让文献综述、基金申请和其他写作任务更容易。我可以通过关键词或相关项目来过滤表格,检索出需要的所有信息,而不需重新阅读。
养成阅读论文的习惯和工作流程,绝对让我成为一个更好的科学家。在更短的时间内,我能读到了更多内容,而且我经常从论文中吸收经验,改进实验设计。在准备博士奖学金申请及候选资格考试时,我广泛地运用了这种方法。当我坐下来写我的论文时,我知道,未来的自己会感谢今日的先见之明。
模板地址:
https://dust-bovid-04d.notion.site/ba1bc5022a4d469abd2ea559e80bc56b?v=a953e6bf2a3449e9ab3083154ce2b238
参考资料:
https://www.nature.com/articles/d41586-022-01878-7
https://mayagosztyla.wordpress.com/