以新疆伊犁矿区为研究区，结合该区天山雪融水径流强、侏罗系富煤地层渗透性不均一等典型水文地质特征，通过采用现场取样、电镜扫描、压汞实验、X-衍射、抽水试验等方法，系统研究矿区主要含（隔）水层的宏观水文地质条件、微观含水介质特征及地下水赋存规律，揭示其特殊地层地貌条件下的含水层水动力学特征及地下水运移规律。结果表明：研究区侏罗系主采煤层顶底板砂岩含水层有效孔隙率范围为17.1%～29.5%，新近系与侏罗系隔水层有效孔隙率范围为17.6%～29.0%，含（隔）水层均含有较高的黏土矿物，遇水膨胀泥化，特殊的微观结构及矿物成分使含（隔）水层表现出孔隙率高、渗透性较差的含水介质特征；区域上，第四系孔隙含水层与侏罗系主采煤层顶底板砂岩含水层富水性较弱，部分区域表现出中等富水，以静储量为主，具有区块化特征；系统研究了主要含（隔）水层的水动力学特征与运移规律，第四系受山前宏观地貌及含水介质条件影响，形成了以“斜坡过境流”为代表并以孔隙潜水形式高强度流动的水动力学特征，同时受到下部新近系泥岩隔水层阻隔，与煤系顶板砂岩含水层无水力联系，对煤层回采存在影响的主要为5煤底板砂岩含水层，并针对该层施工了“横向截流，侧向掩护”的“厂”字形大范围疏降且疏降效果显著，为井下回采创造了良好的水文地质条件。相关研究成果揭示了研究区侏罗系富煤地层受沉积环境影响所形成的特殊含水介质特征及储水控水规律，可为研究区及西部矿区相似开采条件下矿井防治水工作提供一定的理论及工程依据。