高硫煤矿闭坑后成为埋藏在地表以下深部的产酸污染场，对相邻含水层和周边环境造成了潜在危害，且因采动效应影响和矿井空间分布复杂导致相邻含水层的污染过程与污染程度评价困难。以某闭坑矿区为研究对象，选取SO42-作为特征污染物，考虑多煤层采动裂隙对含水层结构的破坏影响，运用数值模拟技术对闭坑矿区酸性矿井水中SO42-污染迁移特征进行研究，并分析流体扩散系数对含水层污染物运移的影响。结果表明：SO42-在二叠系童子岩组砂岩含水层中水平迁移面积随时间增大而增大，增大速率逐渐减小，垂向渗透系数扩大10倍，空间变异性增强；闭坑5、10、15年后，最大水平迁移距离分别为215、414、612m，最大垂向迁移距离分别达到50、65、70m；而扩散系数越大，产酸时间越长，SO42-迁移距离和污染范围将随之增大，相较于水平方向，垂向上SO42-浓度变化对扩散系数的敏感度更高。基于模拟结果，结合闭坑矿区实际条件，针对性提出了―源头减量-过程阻断-末端治理‖的综合防控与治理方案。研究结果将为该闭坑煤矿酸性矿井水污染治理与防控提供理论基础，也为其他同类矿井提供科学借鉴。