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主办单位:煤炭科学研究总院有限公司、中国煤炭学会学术期刊工作委员会
遗传算法模拟生物多序列比对之初始化的改进
  • 作者

    李满枝王凯华王洪涛修兴强

  • 单位

    海南师范大学数学与统计学院

  • 摘要
    针对应用遗传算法求解生物多序列比对问题的初始化进行了改进.初始种群是遗传算法构造的一个关键部分,本文根据多序列比对的生物特性,在初始种群中的个体中插入连续空位,优化初始种群的个体质量;并在初始种群中加入一定比例的在线比对工具MAFFT优质种子,优化初始种群的整体质量.通过数值模拟实例结果显示,经过这两个优化处理可以生成更高质量的初始种群,得到更好的比对结果,提高多序列比对的计算效率.
  • 关键词

    多序列比对遗传算法初始化连续空位MAFFT种子

  • 基金项目(Foundation)
    海南省自然科学基金(20151003);国家自然科学基金(71361008);海南省重点项目(ZDXM20130080);
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